“蚊香蝌蚪，你在哪里快点出来。”
“皮丘，皮丘”
这正是小智和皮丘，他们很快扒开了草丛发现了，坐在地上的女孩。
小智：“你在这里做什么，我叫做小智，你呢？”
莎莉娜：“我叫莎莉娜，我的腿受伤了，好痛哦！”
“站不起来了吗？”小智思考了一下，拿出了自己的手帕，给莎莉娜进行了简单地包扎，用充满童真地说道：“告诉你一个咒语哦！痛痛痛飞走了。现在你可以起来了吗，莎莉娜？”
莎莉娜用手扶着地面，尝试着站起来，可由于疼痛，仍然站不起来。
“小智哥哥，好痛，站不起来。”
“莎莉娜，要记得不到最后一刻，绝对不能放弃！”说完，小智就伸出自己的手把莎莉娜拉了起来。“你看，这不就起来了吗？”
小智的这一拉，由于惯性的原因，莎莉娜正好抱住了小智，脸也正好贴在小智的膛上，导致莎莉娜红透了脸。
这时候森林的另一边，那个叫做小茂的刺猬头少年也进来了。
“小智那个家伙到底跑到哪里去了？竟然要本少爷来找。”小茂在森林里一边走一边抱怨。
在小茂抱怨的时候，小智和莎莉娜。两人结伴向着森林出口走去，但是就在这个时候，两人发现了两颗蛋在前方。
小智拿起一颗蛋说道：“这就是宝可梦蛋吗？而且还是两颗奇怪，怎么附近没有他们的父母呢？”
莎莉娜拿起另一颗蛋：“难道说他们是被遗弃的？”
“咿呀”这时一声尖锐的少女尖叫声响彻了整片森林。
“刚...刚才那阵叫声是怎么回事儿？”莎莉娜问道
“这么大的叫声，是小蓝吗？”小智说道
不止他们听到了，小茂自然也听到了，这个声音，于是跑过去一探究竟，结果不到一秒就立刻跑回来了，因为小蓝的身后，不知道为什么，居然有一群大针蜂。
“妳到底是怎么招惹大针蜂群的？”小茂一边跑一边问。
“我追着一只独角虫，结果不小心误入他们的巢穴。”小蓝说道
小茂很无语啊，俩人继续跑着。
转到小智这一边，似乎是因为刚才那阵叫声，小智和莎莉娜怀中的两颗蛋开始动了起来。
“哎，要孵化了吗？”小智说道
随着两颗蛋的破碎，小智手里的出现一个类似兔子一样的生物，有一张大口。
莎莉娜手里出现的是一个毛绒绒的球，头上有一个角，这个时候两只数码兽身上发出了光。同时他们两人被一束光笼罩着
两人再次睁开眼睛的时候，发些自己站在一个白色的空间里面，前有一个人，身边还有一只白色的半人马。
小智拉着莎莉娜的手问道：“请问你们是谁啊？这里是什么地方？”
阿尔宙斯：“我的名字是阿尔宙斯，这里是我的超克空间，你们不需要担心。我们把你们带来是有件事要告诉你。”
莎莉娜问道：“请问是什么事？”
龙道：“先自我介绍一下，我的名字是御世龙，我希望你们能够帮助我打倒千年兽。”
小智：“千年兽？是新种宝可梦吗？我从来没听过诶。”
御世龙摇摇头：“哦，千年兽不是宝可梦，他是数码兽，所谓数码兽就是数据所结合在一起形成的生命体的存在。和宝可梦很类似，你们手中的就是数码兽，你手中的叫做滚球兽，那个女孩子手上的叫做独角兽。”
小智道：“你叫滚球兽嘛，你好滚球兽，我叫小智。”
滚球兽：“你好！”
莎莉娜惊讶道：“他会说话，那你是不是也会说话呢？独角兽，我叫莎莉娜。”
独角兽：“你好，莎莉娜，我的名字是独角兽请多指教。”独角兽说着，脸上还有两片红晕。
御世龙：“好了，自我介绍就到这里吧，现在听好，千年兽是从人们的内心的黑暗中所诞生出的最邪恶的存在，我们一直在与千年兽对抗着，但是千年兽，却跑到了这个世界，按照规定，我们是不可以干涉其他事件的。所以我们只能拜托给你们，这两只数码宝贝合体，进化后的奥米加兽是对抗千年兽的存在，他们已经选择了你们作为他们的搭档，所以希望你们能够带着他们去击败千年兽，他们现在虽然很弱，但是经过了锻炼后，他们能够变得更强，就能够进化，可以吗？可以拜托给你们吗？”
小智道：“啊，没问题，拯救世界啊，好，就让我未来的宝可梦大师做这件事吧。”
莎莉娜道：“小智，你怎么就随便答应，那我们现在什么都还不懂呢。”
御世龙道：“没关系，这段时间，我会告诉你们关于数码兽的事情，还有这件事除了你们二人之外不要告诉任何人，这这个是暴龙机，有了它，你们就可以察觉到数码兽们的资料，同时还可以把数码兽们放进去。注意不要被人发现。”
小智道：“为什么？”
御世龙道：“因为我们担心有人知道这件事会利用数码兽。”
阿尔宙斯道：“我们从你的身上感受到了和他们不一样的存在。所以说我们决定相信你。我会一直关注你的，同时我也会让所有传说中的宝可梦关照你。”
御世龙道：“好了，你们也该回去了，等你们想见我的时候就来到这个地方，用你们的暴龙机对着天空喊着转移，你们就能来到了。”说完俩人就回到了原地。
“小智！快跑啊！”这时小茂和小蓝一边喊着，一边快速的从他们俩他们的身边经过。
“哦！”小智和莎莉娜面面相觑，不到一秒，两人立刻逃跑，因为后面一大群大针蜂正怒气冲冲的冲过来。
“怎么会有这么多的大针蜂啊！”小智问小茂。
“是小蓝惹的祸了，现在还是逃命要紧！”四人继续逃亡。
夏令营营地，孩子们都已经回到营地了，大木博士统计了一下，发现小智，小茂，小蓝，莎莉娜还没有回来，心里开始担心起来了。
另一边四人仍在奔跑着也不知今天是不是超级倒霉日，小茂在逃跑的时候无意见踩到了一只烈雀。
于是烈雀群也加入了这场争夺追逐战。
“小茂，你别添麻烦好吗？”小智对小茂抱怨到
“本少爷又不是故意的”小茂也回到
“好啦，你们两个给他，省点吵嘴的力气，赶紧跑吧。”小蓝也很无语了
莎莉娜什么也没说，只是被小蓝牵着跑。
眼看他们就要跑出森林了，突然两只宝可梦挡住了去路，是尼多王和尼多后，于是分成两队，从他们两边绕了过去。
森林外面，夏令营营地
大木博士看着四人回来，心里的大石头终于放了下来，然而还没有喘口气，尼多王和尼多后以及一大群大针蜂和烈雀从森林里冲了出来。
“不是吧，居然追到这里来了。”小茂说道
“他们还真有毅力呀！”小智说道。
其他参加夏令营的孩子们都很惊慌。
就在大木博士准备出手的时候，三道威力巨大的破坏死光，直接命中了它们，产生了大爆炸。
爆炸过后，那群宝可梦全部都躺在地上烧蚊香，而众人的面前，则是站着三道强壮的身影。
“岩神柱雷吉洛克，冰神柱雷吉艾斯，钢神柱雷吉斯奇鲁。”大木博士一眼就知道他们的身份了。
随后，那群宝可梦全部都逃回了森林里，三神柱也离开了，只有小智和莎莉娜察觉到三圣柱在离开的时候向他们稍稍点点头。
“好了，你们给我解释一下，到底怎么回事儿吧。”大木博士对着四人问道。
就这样夏令营的第一天就这么过去了。
夏令营第二天自由活动的时间，小智拉着莎莉娜再一次进入了超克空间。
不过由于昨天的事情四人都受到了大木博士严厉的批评，所以不能走的太远，不过大木博士也管不住他们，因为大木博士又发现两个孩子擅自行动了。
大木博士觉得心很累，带一群孩子来参加夏令营，结果一半的孩子都不听他的指挥，擅自行动。
超克空间
御世龙道：“你们来了！”
阿尔宙斯：“等你们很久了，现在起我们会教导你们关于宝可梦可梦还有数码兽们的知识，要认真听哦。”说完阿尔宙斯化成了一个白裙的少女。
小智：“那个这个的讲座会很久吗？要是离开的太久大木博士又得骂我们了。”
御世龙：“不用担心，在这里的时间流逝是这很慢的，你们在这里呆几个小时，在外界也只不过是几分钟。”
“好了，现在我们开始上课。”阿尔宙斯说着打了一个响指，两张桌子和椅子出现，小智和莎莉娜坐在那里，同时滚球兽和独角兽也坐在桌子上。皮丘则是趴在小智的头上。
命运之子和数码宝贝就这样相遇了。千年兽究竟会有什么样的阴谋呢？