在经历了巨大快龙事件之后，五人终于抵达了枯叶市。
到达枯叶市后，众人立刻冲入宝可梦中心，进行了一番洗漱调整。
乔伊走过来道：“请问你就是真新镇的小智吗？这有一封给你的留言。”
小智接过之后打开留言：“小智，看到留言跟我联络，我是大木博士。”
“原来是大木博士的留言啊，可是他有什么事呢？”小智接通了大木研究所。
“小智啊，你打电话来，就说明你看到了我的留言吧，那就说明你们应该到了枯叶市。”大木博士在另一头说道。
小智：“我去请问你留言让我联系你有什么事吗？”
大木博士：“是这样子的，我以前的一个学生樱木，他现在在枯叶市开了一个研究所，他最近跟我说，枯叶市周围有一股强大的能量，似乎跟传说中的宝可梦有关，而且听说那个研究所好像有什么事件，所以想拜托你帮忙去一趟。但是小茂他我联系不上，还有解决完了之后他会给你圣安奴号的船票，圣安奴号是豪华的大客船。”
小霞：“真的吗？圣安奴号的船票啊，我们会去看看的。”
大木：“那就这样先挂了。”
小黄：“小智哥哥，既然这样，那我们就去看看吧。”
小刚：“没错，大木博士的后辈，有值得去见见。”
小智：“没问题，等我挑战完道馆之后就去。”
枯叶市道馆挑战直接略过，马志士的雷丘直接被皮卡丘KO
得到了橘色徽章的小智一行人来到了樱木研究所，发现樱木研究所已经聚集了很多训练家。
樱木博士：“我们观测到在港口地区出现了黑云，很有可能是传说中的宝可梦之要出现的征兆，所以拜托在场的各位训练家们请去调查看看。”
得到了这个消息的，众训练家们立刻冲向了港口，只留下了小智一行人。
樱木：“你好，你应该就是小智了吧，大木博士跟我说过你的事。”
小智：“您好，英文博士，我已经知道了，你说的没错，的确是传说中的宝可梦，而且还是我们的老朋友。”
樱木：“老朋友这么说，你知道这一只是什么宝可梦？”
莎莉娜：“没错呢，根据这个气象来看的话，很有可能就是洛奇亚。”
“洛奇亚！！”×4
小智：“总之我们去看看吧，顺便介绍一下我们的朋友。”
莎莉娜：“跟我们来。”
两人说着来到了港口处，小刚三人还有樱木博士也跟了过来，同时跟过来的还有一男一女，看起来和小智的年龄差不多，很明显是青梅竹马，不过小智和莎莉娜一眼就认出了他们，毕竟曾经一起参加过夏令营。
樱木博士：“介绍一下，这位是我的女儿小春，然后这位是她的青梅竹马小豪。”
小春：“请多关照啊。”
小豪：“你们好！”
小智：“两位，好久不见了。”
小豪：“我们认识吗？”
莎莉娜：“真是的，我们不是在夏令营大木博士的夏令营中见过面吗？”
小豪：“是吗？我不记得了，我只记得我在那里看见了梦幻，其他的我都不记得了。”
莎莉娜：“当时你就说要捕捉梦幻，你还没有放弃呀。”
小豪道：“我不会放弃的，我未来的目标就是要收服梦幻。”
“真是的不切实际的梦想，两位的确很久不见了。”小豪不记得，小春记得啊，所以小春跟他们打了一声招呼。
嗯啊——
随着一声嘶吼，那乌云化作一道圆体乌云，然后直接消散，从中浮现出白色大型宝可梦的身影。
果然如小智所想的那样是洛奇亚。
而那些路人见是洛奇亚，也想
到了与之对战甚至是收服，各自派出了自己的宝可梦与其交战，于是之后便成了数只宝可梦与洛奇亚交战的场景。
但是洛奇亚实力强劲，那些宝可梦即使数量多，也无法对洛奇亚造成一丝威胁，洛奇亚再给了对方每一只宝可梦进攻与自己的交锋机会之后，便开始反击，一道收敛威力气旋攻击直接将众多宝可梦击退甚至是失去战斗能力。
好强!”，那些宝可梦的训练家亲身体会到了传说的强大。
而洛奇亚击败了那些人之后并没有离开好像发现了小智，然后又是一道气旋打了过来。
“皮卡丘，十万伏特”。
看着袭击过来的气旋攻击小智并没有慌，而是直接下令让皮卡丘使出拿手技能，于是很快一道强大的金色电流从皮卡丘那小小的身躯倾泻而出。
很快两道绝招在港口互相碰撞，互相消散。
之后洛奇亚降落到了这里。
小智：“洛奇亚，好久不见，没想到你居然会来到这里呀！”
莎莉娜：“就是，洛奇亚，那一次之后，我们就很久没见面了呢。不过一见面就来了一发气旋攻击，就可不礼貌哦。”
洛奇亚：（呵呵，别介意呀，这不是见到你们太高兴了，打着招呼而已嘛。）
小智：“不过下一次不要用这种方式打招呼喽。”
“没问题，话说他们是你们的同伴吗？”洛奇亚看着其他人
小智：“没错，现在是我们一起旅行的同伴。”
小黄：“你好我叫小黄，洛奇亚，很荣幸能见到您。”
小刚：“我的名字叫做小刚，洛奇呀，啊，你好，请多指教。”
小霞：“我是，小霞，洛奇亚，我很喜欢你。”
洛奇亚：(你们好哦！)
小春：“真没想到，洛奇亚居然会在我面前，真是厉害！”
小豪：“洛奇亚，请多指教。”
小智：“洛奇亚，可以带我们上去飞一飞吗？很久没坐你飞了呢。”
洛奇亚：没问题，老朋友见面很高兴上来吧。
小智拉着莎莉娜跳上了洛奇亚的背后接着众人全部都上了去，樱木博士没有上，反而是回研究所去了。
洛奇亚：都坐稳了，要出发了。
说完洛奇亚振翅飞上了高空。
蔚蓝的天空，云彩飞快掠过，在飞行一段时间后洛奇亚的速度逐渐平稳，不再无限制的加速，渐渐地，在它的周围已经聚集着一群飞行系的小精灵，与其并排而飞。
比比鸟，大嘴鸥，青绵鸟，甚至还有随风而起的毽子草一同飞翔。
“啊，很久没有这样享受了呢。”
“就是呀！”
小智和莎莉娜靠在洛奇亚的背鳍上，看着眼前的一幕，非常享受着惬意的下午时光。
至于小刚小豪等人，则是非常兴奋，毕竟能乘坐传说中的宝可梦，洛奇亚。可是很难得的。
“抓紧了。”
下一刻，洛奇亚朝着海面俯冲而下，加速撞击海面。
眼看着就要撞击在海面上，一道粗壮的水柱忽地从洛奇亚的口中喷出，猛烈地击打在平静的海面上，隔开了周围的海水，出现了一条进入大海的通道，形成了一道彩虹，洛奇亚从那条彩虹中穿过，那么景色让所有人都感到迷恋。
“要上了。”
说完，洛奇亚直接冲进了水中，洛奇亚，在水中自由的畅游，同时也让大家观赏到了许多的海底的宝可梦。因为有着洛奇亚的力量，所以大家在水中也能自由呼吸。天空中截然不同的景色，但却同样的充满魅力。
成群结队的弱丁鱼相互盘转形成螺旋状，看上去仿佛建造出了一座海底的螺旋阶梯。
霓虹鱼和荧光鱼相互追逐嬉戏，身上闪烁出的炫丽的光芒，将海底照亮，在冰冷的海底甚至带来一丝来自内心的暖意。
墨海马，海刺龙，好奇地伴随左右，打量着洛奇亚一行，与他们并排而行。
在海底深处，也有许多宝可梦静静地栖息着。
这一景象让小春也非常的惊讶，也是瞪着眼睛感到惊奇。最后洛奇亚冲出了海面。
在天空与海洋先后观光，洛奇亚又一次带着众人来到一处草原，见到了大量的草系宝可梦与在他们脚下奔跑的烈焰马之类的宝可梦。
于傍晚时分洛奇亚重新回到了枯叶市，降落到了樱木研究所前。
到达樱木研究所后，众人都从洛奇亚的身上下来。
小豪：“真是，谢谢啊，洛奇亚这一次，真是收集到很棒的数据啊。”
小春：“没错呢，宝可梦！真是不可思议呢！”
洛奇亚：“你们喜欢就好，好了，我离开的太久了，是时候该回海底了。我也该离开了，今天能够见到老朋友就飞了这么一圈很是高兴，如果你们来成都地区的话，欢迎来漩涡列岛，这是我的羽毛，上面有我洛奇亚的祝福，小智交给你了。”洛奇亚将一片羽毛交给了小只，之后就飞上了天空，离开了枯叶市。
小智：“洛奇亚，以后有机会再见了。”
莎莉娜：“替我向他们问好哦。”
告别了洛奇亚之后众人进入了樱木博士的研究所。
樱木博士：“哦，这可真是厉害的数据呀，小豪真是不错，还有小智，真是谢谢，如果不是你和洛奇亚认识，小豪恐怕也没有办法收集这种数据。”看着显示在屏幕上的数据，樱木博士很是开心。
小智道：“没有了，对了，话说樱木博士，除了这件事之外，你不是还说樱木研究所有什么事件吗？”
小霞问道：“没错啊，博士是这么对我们说的，请问那个是什么事件啊？”
樱木博士：“对，因为洛奇亚的事，我都给忘了，其实是这个研究所似乎有闹鬼，所以说我希望你可以帮我们看看到底是怎么回事儿。”
“闹鬼”几个女孩子都很害怕这种事所以抱在一团。
小智：“放心，交给我吧，所没闹鬼一定是幽灵神奇宝贝搞的我会收服他的。”