次日，在与空木博士和海德先生告别后，小智一行人开始朝漩涡列岛大赛举办处赤岩岛出发，在经历了灯笼鱼大游行之后，又在大波波之导线照顾了巨大的大波波
今天一行人到达了漩涡列岛的第二岛黄岩岛。
“介绍上说，这个黄岩岛是发展果园、养殖场、梯田、水产的岛屿，而且那里的岩石与地板都是黄色的，据说他与附近的其他三座岛屿都是按照石头的颜色来命名的”
“原来如此！”
“救命啊！”这个时候他们听到了求救声，过去一看...
“不好，那里有个屋子被冲到水里去了”，听到求救声，放眼望过去，就看到一处木屋飘在大海上，而屋子上还有一个小女孩和一只太阳珊瑚
小智赶紧放出了全部的水系宝可梦一起合作将整座木屋和小女孩以及太阳珊瑚都给包裹，然后载着他们一起游到岛上，将她们救了下来
“真的谢谢你们救了我妹妹露佳。上岸后一位大叔和一位大姐姐赶了过来，原来是这位小妹妹的父亲和姐姐，他们对小智他们救援表示很感激。
“哪里，您的笑容就已经足够了”，小刚看到美丽的大姐姐，瞬间如一道闪电般冲了过去，直接忽略了人家的震惊上前搭讪
“在下名叫小刚，志愿当世界第一的宝可梦饲育家，不光是宝可梦，希望也能培育您的……哎呀呀，好痛”
“对了，你们的屋子怎么会被冲动大海里去的呢？”莎莉娜将小刚移开之后转过身来问
“我们是在太阳珊瑚的巢穴上生活的，这是在黄岩岛自古以来就有的生活习惯，我爸爸是太阳珊瑚角工艺家，因为太阳珊瑚的角会替换，所以生活在太阳珊瑚的巢穴上会比较的方便”
太阳珊瑚也随着这一家介绍的话语一同跳跃着
“好活泼的太阳珊瑚啊”，看着这么有活力的水系宝可梦，莎莉娜有不小的兴趣
“这只太阳珊瑚，我们也不知道是从哪里漂流过来的，它总是喜欢对我们的太阳珊瑚使用冲击绝招，而今天我发现我们家的太阳珊瑚都不见了，而太阳珊瑚不见了后，巢穴的壳就开始变硬，使得我们家滑入了海中”
“在那之前还有别的事情”，这次是小刚的反攻，拽住了小霞的耳朵
“我们得找回那些不见了的太阳珊瑚才行，他们一定还在这个岛的某个地方”
“皮卡丘，我们也来帮忙吧”
‘皮卡！’，皮卡丘指了指小智腰间的两颗精灵球，然后指了指背包里的东西，小智很轻松的就理解了皮卡丘的意思
“皮卡丘，你脑子转的真快啊，这样一来一定很快就可以找到太阳珊瑚他们。就决定是你们了，猫头夜鹰还有菊草叶”
‘咕~’、‘奇可~’
菊草叶一出来就跳到小智的怀里，小智抱着菊草叶轻轻的抚摸了一会然后轻声说道
“这里的太阳珊瑚走散了，希望你们能用一下自己的能力寻找一下，猫头夜鹰你的识破绝招还有菊草叶你的测温能力应该能够很轻松找到的，找到之后就拜托你们通知我们了，我们也会去寻找的”
猫头夜鹰和菊草叶各自观察了一下这边的太阳珊瑚之后确定了他们种族的模样和体温之后就各自走开去寻找了
猫头夜鹰和菊草叶离开之后，一行人也散开寻找。
随后众人再岛上四处行走，各自都找到走散的太阳珊瑚，然后将其一一聚集起来由他们点清了太阳珊瑚的数目，核对完发现全部找着了，就准备汇聚在一起。
“小偷，有小偷”，众人刚刚汇聚，就听到有人呼喊，然后冲了过来，将太阳珊瑚他们一一冲散，这可让他们白忙活了。
当人群散去之后，发现他们面前出现的是火箭队，这可让大家不好受了，小智准备直接出手教训他们。
“小鬼头！”喵喵惊慌的看着小智他们。
“啊，那些是我做的工艺品”，看到武藏满身的太阳珊瑚工艺品，露佳的爸爸一下就认了出来。
“美丽的东西只适合用在我这种美丽的人身上”，武藏转了好几个圈，而且心情不错
“去吧，大食花”，小次郎今天非常的果断，派出了大食花
“不对，不过，敌人在那边”，不过还是例行的被大食花给啃了
“阿柏怪，去为女王我作战吧”
“猫头夜鹰，菊草叶，就决定是你们了”，小智直接把出来寻人的两位的宝可梦派来出战
“大食花，使用飞叶快刀”，“阿柏怪，铁头功”
“猫头夜鹰，躲开之后对阿伯怪催眠术，菊草叶，这边也飞叶快刀”
大食花扇动着叶片状的两肢，偏偏绿叶向这边打来，阿柏怪那边的头也狠狠的撞了过来，猫头夜鹰抓着菊草叶，升空躲开了两者的攻击，然后双眼对阿伯怪进行催眠暗示，菊草叶亦在上空甩动叶片，将飞叶快刀击打在行动因催眠术而稍显迟缓的阿伯怪身上
“两个都攻击我的阿伯怪，太不公平了吧！你们也去攻击小次郎的大食花啊！”
“你们作为坏人还说什么公平不公平的…”，莎莉娜感觉这些人也太那个了吧
“猫头夜鹰还要菊草叶，一起用冲击绝招”
猫头夜鹰带着菊草叶一起往下俯冲，朝着大食花攻击过去，这让小智自己都有些不解，不过在看到阿伯怪接下来的状态之后小智也清楚了猫头夜鹰之前的作为，因为阿伯怪居然和猫头夜鹰他们一起去攻击大食花了
毕竟初代的催眠术如同幻术一般，可以制造幻象，可以让人把石头看做是猫头夜鹰，可不仅仅只是进入睡眠状态这么简单，于是刚才猫头夜鹰催眠的时候就是让阿伯怪把大食花看做是自己，这样就形成了三对一的局面，到时候自己这边再二打一
大食花被众人一拥而上，短短数秒便败下阵来，猫头夜鹰再转头攻击阿伯怪，还在催眠状态没有缓过神来的他被打了一个措手不及，一起丢到了火箭队他们身上
“皮卡丘，最后一击的十万伏特”
“好讨厌的感觉”
赶跑火箭队之后大家开始重新寻找又一次走散的太阳珊瑚，因为有之前小智与他们触碰，气息已经很熟悉了，于是很简单的又重新将他们聚集在了一起，并将他们带回原处
事情解决完了之后，终于准备那只野生的太阳珊瑚被莎莉娜收服。