元统元年，刘基二十三岁，赴京城大都参加会试，一举考中进士。但因元末兵荒马乱，又朝廷从来蔑视南人，故此未曾入仕，在家闲居三年。至元二年，被元朝授为江西高安县丞，协助县令处理政务。虽然官小职微，但刘基勤于职守，执法严明，对劣迹昭著豪强恶霸坚决予以严惩，并对县衙内贪赃枉法官吏进行整治，高安县社会风气很快好转。刘基任官五年，发奸摘伏，不避强权，地方豪绅恨之入骨，幸得长官信任，方得免于祸患。其后刘基辞官返回青田，蛰居隐退，便于此时幸遇张三丰仙师，得传鬼谷秘籍，并为第五十八代掌门。至正十二年七月，徐寿辉攻陷杭州，朝廷起用刘基为江浙省元帅府都事，助官军平定浙东方国珍。元左丞帖里帖木儿欲招安方国珍，刘基认为不诛方氏兄弟无以惩后。方国珍重赂官府，终被招安，反而谴责刘基专擅威福，刘基一怒之下辞官还里，复又隐居八年。
至正二十年，朱元璋将刘基请至应天，委任为谋臣。刘基建策，无不采纳，遂辅佐朱元璋集中兵力先后灭陈友谅、张士诚等。并建议朱元璋一方面脱离小明王韩林儿自立，另一方面以圣火令招揽天下义师民心。陈友谅攻陷太平，意欲东向，气势甚为嚣张。朱元璋帐下诸将畏其势力，皆无战心。刘基单独献策道：“臣谓凡是言降或议逃者应尽诛之，以免扰乱军心。陈友谅骄气冲溢，目空一切，我宜用其骄傲自满时机诱敌入伏，一举重创，灭其锐气。天道后举者胜，我以逸待劳，何患不克？莫若倾府库，开至诚，以固士心，伏兵伺隙击之，取威制胜，以成王业，在此举也。”刘基寥寥数语，拨开迷雾，点破形势，议定决策，朱元璋喜而从之，果灭陈友谅、张士诚等。至正二十七年，刘基参与制定朱元璋灭元方略，终将蒙古人驱回漠北，实现张三丰当年所托。由此在朱元璋帐下共参与军机八年，筹划全局。朱元璋建吴国之时，以刘基为太史令，制定《戊申大统历》。明王朝正式建立，授刘基为御史中丞兼太史令。其后明太祖借胡惟庸案大杀开国功臣，惟刘基施计得免，此乃后话。
在民间传说之中，刘伯温与兴周姜子牙、复汉诸葛亮、兴唐徐茂公一起，皆谓是神人下心，以佐圣主者。尤其刘伯温，盛传其“前知五百年、后知五百载”，并有预言神书《烧饼歌》传世。相传刘伯温本是玉帝身前天神，元末天下大乱，玉帝令刘伯温转世辅佐明君，以定天下，并赐斩仙剑，号令四海龙王。但东海龙王年老体弱，事务繁多，因此派出九子听命刘基差遣。龙王九子各有法力神通，跟随刘伯温征战多年，为朱元璋打下大明江山，后又助朱棣夺得皇位。明成祖朱棣欲将龙王九子永远留在身边安邦定国，雄霸天下，便借修筑紫禁城为名，借刘伯温斩仙剑号令九子。又骗老大赑屃驮走先祖神功圣德碑，借真龙天子功德以及两代帝王玉玺印章将其镇住。其余八子眼看大哥被压在碑下，不忍离去，便决定一起留在人间，但发誓永世不现真身。朱棣虽然留住九子，但所得仅是九个神兽塑像。刘伯温得知此事甚为不满，乃弃朱棣而去，脱离肉身返回天廷。朱棣便让九子各司一职，流传千古。
列位看官！你道自元朝之前，中国历代国号皆以皇帝起家发迹之地或其最初封地为名，周、秦、汉、吴、蜀、魏、隋、唐、梁、晋、辽、夏、宋等无不如此；元朝发迹不在中原，故其国号取自《易经》，则朱元璋起始亦称吴王，却因何终以“大明”作为国号耶？其实皆因他这个天下，乃是刘基借明教势力帮其打下，以此为国号，是慰功臣将士及天下教徒之心也。至若其后大清朝，亦因起源发迹非在中原之地，故不取地名，而借蒙古语“代青”谐音为之，意谓“至高无上之国”也。闲话少叙，便说明教由来，以为本书结语。且说明教正式名称是为摩尼教，又作牟尼教，发源于古代波斯萨珊王朝，为公元三世纪中叶波斯人摩尼所创。摩尼以琐罗亚斯德教二元论教义为基础，复又吸取基督教、佛教、诺斯替教等思想，主要教义为“二宗三际论”，崇尚光明。所谓“二宗”，是指世界本原，即黑暗与光明、善与恶；“三际”是指世界发展三个过程：即初际过去、中际现在、后际将来。
摩尼于西元二四二年在巴比伦传教，二七七年被钉死在十字架。摩尼声称自己是佛祖、琐罗亚斯德以及耶稣继承者，也是人类最后一位先知。摩尼教在诺斯底主义影响下主张灵魂从肉体上彻底解脱，因而强调禁欲、食素。教义中包括佛教转世说及叙利亚天使说，认为光与暗、善与恶永远敌对。摩尼教反对犹太教，将其视为黑暗神所创。起初在巴比伦、波斯传教，但在巴赫兰一世时期因与祆教矛盾，教徒被迫出亡。有些抵达罗马帝国，但罗马人崇拜奥林匹斯诸神，信徒大都被烧死或斩首，只有到达中国西域河中后摩尼教才可立足。因其简明直接，颇受当时人欢迎，故能传播于中亚、印度、中国等地，至宋末元初极为兴盛。摩尼教约于六至七世纪传入我国新疆，复由新疆传入漠北回纥，而盛行于该地。唐代宗大历三年，朝廷应回纥之请于江淮等地建立摩尼寺，唐武宗会昌灭佛，摩尼教亦遭严重打击，转而成为秘密宗教，并吸收道教及民间信仰，从而改称明教。明教因相信黑暗就要过去，光明即将来临，故敢于造反，屡有反政府之举。其后明教又与弥勒教、白莲社相结合，而演变成明末白莲教。明教一词至清代虽已不复见于文献，但“明王出世”之说犹自流传于民间。
中国明教发展，混合有道教、佛教、白莲教等成分。五代十国、宋、元、明农民起义常利用为组织工具，皆尊张角为教祖，敬摩尼为光明之神，并崇拜日月。教徒服色尚白，提倡素食、戒酒、裸葬；讲究团结互助，称为一家，认为世上光明力量终必战胜黑暗。五代梁贞明六年母乙以此发动起义。两宋时流行于淮南、两浙、江东、江西、福建等地，不断组织农民起义，方腊、王念经起义均借明教之名。摩尼教经典《下部赞》叹明界文如是说道：“光明普遍皆清净，常乐寂灭无动诅。彼受欢乐无烦恼，若言有苦无是处。常受快乐光明中，若言有病无是处。如有得住彼国者，究竟普会无忧愁。处所庄严皆清净，诸恶不净彼元无；快乐充遍常宽泰，言有相陵无是处。”光明王国波斯称为察宛，东土称为明父、大明尊。黑暗王国由黑暗魔王统治，五类魔整天沉溺在情欲、争吵之中，诞生人类祖先。因为人类是黑暗之魔子孙，大明尊便派遣光明使者，拯救人类灵魂。则天武后延载元年，波斯人拂多诞将摩尼教传入中国，唐朝大历三年于长安建有大云光明寺，承认明教合法地位。
摩尼教传入唐朝同时，不久传入回纥，更被定为国教。安史之乱后，因回纥自恃助唐平乱有功，摩尼教徒藉回纥支持，得以在唐国传教。唐宪宗以后，摩尼教寺满布中国境内，在中国迅速传播，摩尼教徒经常由回纥至唐，并得唐皇室礼待。武宗会昌灭佛时，摩尼教先于祆教、景教被禁，转而在民间秘密流传，并渐与其他宗教结合，历五代两宋仍不衰。自此与下层斗争结合，成为农民起义号召旗帜之一。北宋徽宗宣和元年方腊之乱、建炎四年钟相起义、元惠宗至正十年韩山童、刘福通起义，都受摩尼教影响。摩尼教由是名为明教，教义被归纳为“清净、光明、大力、智慧”八字，教众囊括农民、秀才、吏员、兵卒、绿林好汉、江洋大盗、武林俊彦等，皆白衣乌帽，秘密结社，共同尊奉明使为教内尊神。为避人耳目，免遭官府查禁，除浙江称摩尼教、福建称明教外，淮南称“二桧子”，江东称“四果”，江西称“金刚禅”，福建又称“揭谛斋”。元末红巾军多白莲教徒，首领韩林儿又称“小明王”，便与明教有关。朱元璋称明教以淮右布衣起事，据长江而最终统一北方，绝无仅有。
按下刘伯温借明教助朱元璋立国，单说张三丰将鬼谷掌门之位传授刘基之后，由此放下心思，更无红尘牵挂，后仍入秦，居金台观。张三丰离别金陵之时，预知爱徒沈万三将有发配边疆之祸，遂叮嘱道：“东西王气正旺，今后我师徒当在西南相会也。”至正十九年九月二十日，张三丰阳神出游，久睡不醒。弟子杨轨山以为师傅羽化，置棺收殓。适逢张三丰阳神回归，念杨轨山朴实善良，遂携其隐去。后元朝数尽，明主未立，张三丰又结庵武当山，搜奇揽胜，乃言“此山异日必大兴”。遂领道众将各处宫观废墟一一清理，草创庙观以延香火。时授高足有邱元清、卢秋云、张振洋、叶阳、张景涛、孙碧云等，张守清也得与三丰相交，结为道友。洪武十七年至十八年间，朱元璋两度诏请三丰入京，皆避而不见，洪武二十三年，张三丰离开武当复作云游。洪武二十五年，张三丰遁入云南，沈万三因得罪朱元璋，全家发配云南，恰遇张三丰，正应“日后当于西南会面”之说。张三丰遂命沈万三服食丹药，夫妻得服遂白日飞升。永乐初年，朱棣命侍读学士胡广诏访三丰，岂料胡广在武当与三丰遇而不识。朱棣怒斥胡广寻三丰不力，胡广再访武当，张三丰现身言道：“你且回京见驾，言我即去便是，不必多虑。”胡广便策马还京，乃知三丰先生早于金殿与永乐帝会得一面。其后明英宗赐为通微显化真人，宪宗封为韬光尚志真仙，世宗封为清虚元妙真君。
清雍正初年，有汪梦九先生曾遇张三丰真人，多受其教，此时三丰应有数百岁矣。史说引导张三丰出家者乃是丘真人，终南山传诀得道者乃是火龙真人，后又师承华山睡仙陈抟老祖。清代道士李西月因此将张三丰归为以陈抟为代表隐仙派，并排列其师承统序为：麻衣传希夷，希夷传火龙，火龙传三丰。朱元璋建立明朝，张三丰曾出手相助其夺取江山，朱元璋登基后多次派人寻找张三丰，亦于史册有载。明成祖朱棣自诩真武大帝化身，北建故宫，南修武当，派吏部尚书郭琎、隆平侯张信等率领兵士三十万，大修武当山宫观，花费达千万计。又亲下圣旨敕封武当山，于是龙虎、武当、华山、九华、茅山、罗浮诸山，道宗极盛。
张三丰文武双全，前无古人，后无来者。其文著述丰富，诸如《玄机直讲》、《打坐歌》、《玄要篇》、《无根树》等先后被清代汪锡龄、李涵虚编辑成集，是为《张三丰先生全集》。其武内家拳集养生之道与技击之法为一体，至今习练者遍及全球。张家拳打法本有一首长长歌诀，然非习武者难于领会其意，正如内家拳师所自诩云：“铁鞋踏破江湖上，不及张家妙术工。”此相传张三丰在武当山观鸟蛇相斗，当鸟上下飞击长蛇，蛇就蜿蜒轻身摇着闪避，相持时久，鸟已精疲力竭，无可奈何飞走。张三丰由此启发，以柔可以克刚，以静可以制动，于是创造出内家拳。此后内家拳技诸如太极拳、八卦拳、形意拳、五行拳、纯阳拳、混元拳、玄武棍等，都是从此演绎引申而来。内家拳博大精深，派别林立，但都注重内功，阴阳变化，动作沉稳，姿势含蓄，劲力浑厚，神意悠然，以柔克刚，以静制动。张三丰此后又创太极拳，奠基武当道教洞天，是为“内家”武术祖庭之道。张三丰亲传弟子有李玄宗道号“铁蟾子”、王道宗道号“金蟾子”、张清修、李静修、邱元靖等，皆载于史册，传于万世。
此部《太祖令》一书，至此完全结束。正如古风言道，分毫不爽：
人类历史万年长，诸子百家各成行。
五行八作何所谓，官吏学兵工农商。
农业祖师神农氏，渔业伏羲海龙王。
商业祖师陶朱公，养蚕祖师马头娘。
纺织祖师黄道婆，陶业亦尊范蠡郎。
铸造太祖李老君，钧瓷烈火圣母昌。
盐业祖师是葛洪，茶叶陆羽酒杜康。
酒席祖师詹王谓，帝予造醋兴晋唐。
蔡伦造纸蒙恬笔，指南火药归炎黄。
陆毒大王造玻璃，祝融鞭炮鬼神慌。
张班带头编席篾，水母娘娘卖水忙。
屠宰祖师刘关张，郎中华佗走城乡。
医药祖师孙思邈，车行祖师是马王。
牛行祖师谓龚遂，邱长春掌玉器行。
孙膑庞涓兴豆腐，泥面塑业女娲娘。
梅葛二仙主染布，镖行达摩洪拳当。
张鲁二班梳篦匠，木石鲁班无参商。
泥水漆匠鲁班妻，鞋匠孙膑费思量。
面匠祖师吴道子，锔补饿佛坐上方。
狗皮膏药铁拐李，戏业祖师号老郎。
化妆师祖观世音，张果老把道情唱。
皮影戏祖李少君，河南坠子邱祖创。
三皇首创三弦书，或说孔子苗庄王。
评书祖师是魏征，二人转祖乃楚庄。
相声祖师东方朔，太平鼓自朱元璋。
范丹老祖莲花落，数来宝创自丐帮。
吹拉响器祖师旷，拉大片祖袁天罡。
变戏法自吕洞宾，理发自从罗祖昌。
乞丐祖师伍子胥，财神皆拜关云长！